Sekretarijat Ministarstva obavlja poslove od zajedničkog interesa za Ministarstvo koji se odnose na kadrovska, finansijska, računovodstvena, informatička i administrativna pitanja.
Sekretarijat sprovodi javne nabavke, planiranje rada i izveštavanje o radu Ministarstva.
Sekreatrijat se stara o slobodnom pristupu informacijama od javnog značaja, zaštiti podataka o ličnosti, bezbednosti i zdravlju na radu, tajnosti podataka i poslovima odbrane.
Brine o sredstvima za rad i rukovanju opremom i usklađuje rad unutrašnjih jedinica.